左贡县现有森林面积152727公顷，主要集中分布在高山上部和远离干流的较大支沟中。左贡县森林资源比较分散，大多林区分布在交通不方便的偏远地区。在全县16个乡中，乌雅乡的兵达、西冲沟、德荣比、中林卡乡的马拉山，加卡乡的青果村及拉物乡、吾同乡、觉玛乡、美玉乡为森林主要分布地，其中乌雅乡、加卡乡森林蕴藏量最为丰富。受地貌、气候、土壤等经济条件的综合作用，森林植被分布规律在左贡县受到显著制约，森林植被呈间断分布，在海拔3500米上支沟、山腰、山头、阴坡、阳坡，多分部为云杉及冷杉树种；3600—3500米之间分布有高山松、黄果冷杉：在海拔3000米以下分布多为核桃、苹果、梨等经济林木。  

 左贡县总面积11840平方公里（1.184万平方公里），其中有林地面积15万公顷，灌木林地面积11万公顷，青山蓄积量2272立方米。在左贡县境内的分布在玉曲河、怒江流域的东坝、中林卡、下林卡、碧土、加郎、绕金、拉物、觉玛八个乡63个村，平均海拔2606米；受热河谷气候影响，小区域特点明显，特别适宜经济林木的生长。主要种植的有苹果、梨、桃、吉、桔子、石榴、柚子、核桃、花椒、葡萄等十余类品种。由于果皮多为庭院式经营，果品为自产自销。鲜果销售多半市场在县城，干果销售范围可至昌都地区，西藏首府拉萨市及青海省、云南省等。左贡县经济林木年产量可达550吨，其中鲜果年产量为220吨，干果年产量为230吨。 

  全县拥用县级自然保护区1个，乡级自然保护区6个。全县国家级野生动物有：国家一级保护动物——雪豹、白唇鹿、野牛、金雕、斑尾棒鸡；国家、自治区二级保护动物——黑熊、棕熊、藏狐、水獭、喜马拉雅旱獭、马鹿、藏原羚、磐羊、岩羊、林鹿、藏马鸡、大绯胸鹦鹉、藏西猴等；县级保护动物——草羚羊、松鸡、黄鸭等，分布在全县16个乡范围内。据现有资料的不完全统计，现有矿点63处，主要有金、铜、锌等，具有较大的开采价值。