伴随着经济社会发展水平的迅速提高，西藏以城镇为中心的污染物排放呈上升趋势，资源开发利用带来的生态压力加大，加上受高寒等恶劣自然条件及全球气候变化的影响，生态保护与污染防治任务繁重。 “十五”期间，国家投入近1．2亿元，实施拉鲁湿地、纳木错自然保护区管护工程和那曲中部草地国家级生态示范区建设工程。中央财政安排专项资金2677万元，自治区财政安排专项资金1172．1万元，全面加强西藏环保基础工作和能力建设。2006年，国家又投入3504万元，自治区财政投入专项资金388．4万元，加强污染治理、自然保护区管护、辐射环境管理和环保能力建设。

　　据自治区环保局局长张永泽介绍，2006年，西藏致力加强污染防治和环保监管力度，在全区范围内启动危险废物、放射性同位素和射线装置的调查工作，共清查出放射性同位素56枚、射线装置789台（套），并预设了国家辐射监测西藏监测站点。围绕“整治违法排污企业保障群众健康”环保专项行动，自治区诸多部门联合行动，以保障饮水安全为重点，全面开展城镇集中式饮用水水源地环境保护、污染企业治理、重点建设项目环境监察、农产品生产基地及食品加工企业环境监测与监察、矿产资源开发环境保护、青藏铁（公）路沿线环境综合整治等7个环保专项行动，查处环境违法企业202家，其中关闭、拆除16家，停建、停业9家，整改116家。2006年6月，随着日喀则县级环保机构的成立，西藏所有县（市、区）已全部建立环保机构。